孔氏的起源可以上溯到历史传说时期。远古皇帝时代已经有孔姓，因当时有个史官，叫孔甲，曾经作《盘盂》一书，但是因为孔甲之后没有孔姓世系资料，所以一般认为孔姓源于子姓，而源于子姓之孔又有三种说法：

　　第一、根据宋代的《广韵》记载，契是商族的始祖，为子姓，历经十四代，传到成汤，灭下桀，建都于亳。成汤是一个圣明的君主，其子孙中有一支以商族的姓"子"以他字中的"乙"组合起来定为姓氏就是孔氏。

　　第二、根据唐人林宝《元和姓篡》所说，西周初期，由殷绉王的哥哥微子启建立的宋国，为子姓。微子启死后，其弟衍继位。其曾孙的玄孙正考父，是宋国上卿。其子名嘉，字孔父，史称孔父嘉。春秋时期孔父嘉的后代，以孔为氏，就形成了这支孔氏。

　　第三、 另据《姓考》等书的记载，春秋时期郑国（今河南新郑）有出自姬姓的孔氏，卫国（今河南滑县东）有出自古佶姓的孔氏，陈国（今河南淮阳）有出自妫姓的孔氏。